H7 réunit plus de 500 membres sur 5 300 m² à la Confluence (source : h-7.eu), Pulsalys a créé plus de 100 startups deeptech depuis 2013 (source : pulsalys.fr, Les Échos), et emlyon venture labs affiche 1 500 porteurs de projets accompagnés et 1 300 entreprises créées en près de 40 ans (source : incub.em-lyon.com). Ces trois structures donnent la mesure du marché lyonnais : une densité de programmes comparable à celle de la capitale, sans la file d'attente. Ce guide liste les incubateurs et accélérateurs startup à Lyon en 2026, compare leurs programmes, et explique comment candidater.
L'écosystème startup de Lyon en 2026
Lyon est le deuxième pôle startup de France après Paris (source : Mission French Tech / Motherbase, panorama 2025). La métropole concentre ce qui compte pour un fondateur early-stage : des laboratoires de recherche de niveau mondial, un bassin de talents formé par EM Lyon, Centrale Lyon et l'INSA, et un coût de la vie qui permet de démarrer sans lever, sans que le loyer mange la trésorerie.
Lyon, 2e pôle startup de France (chiffres clés)
Le marché startup lyonnais en chiffres :
- H7 : 5 300 m² et plus de 500 membres (startups, corporates, investisseurs, partenaires éducatifs) dans le quartier de la Confluence (source : h-7.eu).
- Pulsalys : plus de 100 startups deeptech créées depuis 2013, au rythme d'une startup deeptech par mois (source : pulsalys.fr, Les Échos).
- emlyon venture labs : 1 500 porteurs de projets, 1 300 entreprises créées, 12 000 emplois directs en près de 40 ans d'existence (source : incub.em-lyon.com).
- I-Factory : 6 500 m² sur le campus LyonTech La Doua, le plus grand espace d'innovation académique de la région, hébergeant 14 partenaires et 400 collaborateurs (source : ifactory.universite-lyon.fr).
Les secteurs porteurs sont la santé (bioMérieux, Sanofi Pasteur, pôle Lyonbiopôle), la deeptech (transfert de technologie via Pulsalys), le numérique et la fintech. Les startups qui s'implantent ici trouvent un accès direct aux laboratoires de recherche, des coûts immobiliers inférieurs à ceux de la capitale, et un réseau où les responsables de programme se connaissent entre eux.
French Tech One Lyon Saint-Étienne et le réseau local
French Tech One Lyon Saint-Étienne connecte les startups locales aux réseaux nationaux et internationaux. En 2024, l'association a contribué à repérer les entrepreneurs du territoire et à les orienter vers les structures d'innovation (source : rapport d'activité French Tech STL 2024).
Trois autres dispositifs complètent la French Tech :
- LYVE Lyon : dispositif d'accompagnement de la Métropole avec plus de 300 acteurs, trois programmes (EARLYVE, LYVE-UP, LYVE-IN) et un nouveau pôle à Vénissieux prévu pour 2026 (source : lyve-lyon.com).
- Centre d'Entrepreneuriat Lyon Saint-Étienne (CELSE) : créé en 2020, hébergé à l'I-Factory, il fédère 26 collaborateurs et connecte les étudiants-entrepreneurs au tissu socio-économique (source : centre-entrepreneuriat.universite-lyon.fr).
- HUB612 : fonds et accélérateur B2B spécialisé fintech/insurtech/SaaS, plus de 80 startups accompagnées depuis 2016, tickets de 50K€ à 1M€ (source : hub612.com).
L'avantage de Lyon tient à la géographie : deux pôles concentrent l'essentiel des structures de ce guide. Le campus LyonTech-La Doua héberge l'I-Factory, Pulsalys et le CELSE, donc la deeptech et l'entrepreneuriat étudiant ; la Confluence accueille H7 et le numérique. Un fondateur qui prend rendez-vous sur ces deux sites a couvert l'essentiel des structures de ce guide.
Les incubateurs et accélérateurs généralistes
Les structures généralistes sont la porte d'entrée du réseau lyonnais. Elles accueillent tous les secteurs et tous les stades, de l'idée au passage à l'échelle.
H7 (5 300 m², le "Station F lyonnais", numérique et innovation)
H7 est le hub d'innovation de référence à Lyon. Inauguré en 2019 dans le quartier de la Confluence, il occupe 5 300 m² répartis en trois espaces : coworking et bureaux, salle événementielle, et un espace restauration ouvert au public (source : h-7.eu). Ses plus de 500 membres mêlent startups, grandes entreprises, investisseurs et partenaires éducatifs, et les programmes sur mesure couvrent le networking, le mentorat et l'accompagnement à la croissance.
H7 s'adresse aux startups tech et numériques en phase de croissance, ainsi qu'aux intrapreneurs et porteurs de projets innovants. Vous y trouvez vos premiers clients, vos mentors, et parfois vos investisseurs, dans le même bâtiment. Le dossier se dépose en ligne sur h-7.eu ; la sélection privilégie l'innovation, le potentiel de croissance et la complémentarité avec la communauté existante.
Lyon Start Up (généraliste, ancrage métropolitain)
Lyon Start Up est un programme gratuit de création de startups, porté par French Tech One Lyon Saint-Étienne. Il propose 70 heures de formation à l'entrepreneuriat, du coaching de pitch, du networking, et un concours de pitch doté de 10 000 € (source : lyonstartup.com). Le programme s'étale sur plusieurs mois, formation puis accompagnement, et accueille les salariés, demandeurs d'emploi, étudiants et retraités porteurs de projet.
Il vise les porteurs de projet au stade de l'idée : vous arrivez avec une envie, vous repartez avec un projet structuré et un réseau.
1Kubator Lyon (réseau national, 200+ startups accompagnées)
1Kubator est né à Lyon en 2016, fondé par Alexandre Fourtoy. Le réseau s'est depuis étendu à plus de 10 villes françaises (Nantes, Bordeaux, Rennes, Lille, Toulouse...) avec un modèle constant : financement de 25 000 € en échange d'une prise de participation, accompagnement sur mesure, et accès à un réseau national de startups et de mentors (source : independant.io, Bpifrance). Le portefeuille compte plus de 200 startups, spécialisées dans le numérique et la tech.
1Kubator s'adresse aux startups numériques early-stage qui veulent un premier financement et un accompagnement structuré. Incubé à Lyon, vous accédez aux marchés de toutes les villes du réseau. Le dossier se dépose en ligne sur 1kubator.com, en sélection continue.
Manufactory / Incubateur Jean Moulin (Université Lyon III)
Manufactory est l'incubateur de l'Université Jean Moulin Lyon III, dédié aux projets portés par des étudiants, des doctorants et des chercheurs de l'université. Il accompagne la création d'entreprise dans un cadre universitaire, avec accès aux ressources de recherche de l'établissement, et fait le lien entre le monde académique et le marché.
Les programmes deeptech et recherche
Lyon est un pôle deeptech de premier plan en France, grâce à la densité de ses laboratoires de recherche et à des structures spécialisées dans le transfert de technologies.
Pulsalys (SATT, transfert techno, deeptech, 100+ startups créées)
Pulsalys est la Société d'Accélération du Transfert de Technologies (SATT) du site Lyon-Saint-Étienne. Créée en 2013 dans le cadre du Programme d'Investissements d'Avenir, elle transforme les découvertes scientifiques des laboratoires de l'Université de Lyon en entreprises (source : pulsalys.fr). Elle a franchi le cap des 100 startups deeptech créées en 2023, au rythme d'une par mois (source : Les Échos), a compté 11 lauréats aux concours d'innovation 2024 dont 6 i-Lab, 2 i-PhD et 3 i-Nov, et s'est installée à l'I-Factory (source : satt.fr).
L'accompagnement couvre la maturation technologique, la détection de projets, le coaching entrepreneurial et le transfert de brevets. Le financement passe par un investissement en maturation et par l'accès au Fonds French Tech Seed via Bpifrance. Les secteurs : biotech, medtech, IA, cleantech, matériaux, quantique, avec des partenariats comme Materi'act (matériaux durables), Inserm Transfert (maladies infectieuses) et M2care (santé).
Pulsalys s'adresse aux chercheurs et doctorants avec une innovation issue de la recherche publique. Si votre projet sort d'un laboratoire et que vous voulez le transformer en entreprise, Pulsalys est votre premier interlocuteur.
Incubateur EM Lyon / emlyon venture labs (1 300 entreprises créées)
emlyon venture labs (ex-incubateur EM Lyon) est l'un des plus anciens incubateurs de France. Depuis près de 40 ans, il accompagne des entrepreneurs à travers des programmes spécialisés sur les campus de Lyon et Paris : plus de 1 500 porteurs de projets accompagnés, 1 300 entreprises créées ou reprises, 12 000 emplois directs générés (source : incub.em-lyon.com, venturelabs.em-lyon.com).
Les programmes se répartissent par stade et par secteur. Startup Camp teste la faisabilité d'un projet ; Numérique Booster accompagne les startups numériques et tech ; des accélérateurs sectoriels couvrent l'agroalimentaire (Le Zesteur), l'éducation et les RH (Ed.Job.Tech), le sport (Sport.Tech) et la deeptech (i-Lab) ; un programme d'accélération de 6 à 12 mois se déroule à Station F, à Paris.
emlyon venture labs accueille les entrepreneurs de tous horizons, étudiants d'EM Lyon ou non.
Tech360 ECAM LaSalle (industrie, IoT)
Tech360 est l'incubateur de l'ECAM LaSalle à Lyon, spécialisé dans les startups technologiques à fort potentiel. Il offre un accompagnement stratégique, du mentorat expert, l'accès à des installations de R&D avancées et un Fablab équipé d'outils de prototypage, avec une possibilité de prise de participation early-stage (source : tech360.fr). Les secteurs : industrie, IoT, technologies de pointe.
Tech360 s'adresse aux startups hardware et industrie 4.0 qui ont besoin de moyens de prototypage. Le lien direct avec ECAM LaSalle vous ouvre l'ingénierie industrielle de l'école.
Les incubateurs à impact et ESS
Plusieurs structures lyonnaises accompagnent les fondateurs qui veulent conjuguer impact et viabilité économique.
Ronalpia (ESS, ancrage territorial)
Ronalpia accompagne les entrepreneurs sociaux en Auvergne-Rhône-Alpes depuis 2013. L'association sélectionne et accompagne des projets à fort potentiel d'impact social et environnemental (source : ronalpia.fr) : 265 entrepreneurs sociaux accompagnés depuis 2014, 7 incubateurs (Lyon, Grenoble, Saint-Étienne, Pays Voironnais, Roanne, Grand-Bourg-en-Bresse, Drôme, Nord Ardèche), un appel à projets annuel en septembre-octobre.
Le programme dure 9 à 12 mois, gratuitement, avec un coach dédié (2 h par mois), des ateliers collectifs et une mise en réseau intersectorielle. L'objectif : un modèle économique viable et un impact social maximal. Ronalpia s'adresse aux porteurs de projets à impact qui cherchent un accompagnement spécialisé ESS ; l'impact social est le premier critère de sélection et de suivi.
Alter'Incub Auvergne-Rhône-Alpes (innovation sociale, gratuit 18 mois)
Alter'Incub est le programme d'incubation de l'innovation sociale en région AURA. Il propose un accompagnement gratuit de 18 mois couvrant la pré-incubation et l'incubation : structuration du projet, aide au modèle économique, mise en réseau. Il s'adresse aux entrepreneurs sociaux en phase de création ; la durée laisse le temps de structurer un projet complexe sans pression de résultat immédiat.
Les Premières Aura (entrepreneuriat féminin)
Les Premières Aura est un incubateur dédié à l'entrepreneuriat féminin en Auvergne-Rhône-Alpes. Il accompagne les femmes porteuses de projets innovants, à tous les stades de développement, avec du mentorat, de la formation et un réseau spécialisé.
Les accélérateurs corporate et spécialisés
Les grands groupes et les réseaux bancaires ont aussi leurs propres programmes à Lyon, avec un accès direct à des clients corporate et à des budgets d'innovation.
Novacité (transition écologique, industrie)
Novacité est un accélérateur spécialisé dans la transition écologique et l'industrie à Lyon. Il accompagne les startups qui développent des solutions pour la décarbonation, l'économie circulaire et l'industrie durable. Si votre produit contribue à la transition écologique et que vous ciblez des industriels, Novacité vous ouvre le tissu industriel lyonnais.
Village by CA (programme corporate, post-incubation)
Le Village by CA Centre-Est fait partie du plus grand réseau d'accélérateurs de startups en Europe, avec plus de 40 antennes en France et à l'international et plus de 1 000 startups accompagnées (source : levillagebyca.com, LinkedIn). Le programme dure 12 à 24 mois, contre un forfait mensuel dont le montant n'est pas publié, sans prise de participation, et met en relation avec plus de 800 grandes entreprises partenaires.
Il s'adresse aux startups en phase de commercialisation qui cherchent des clients grands comptes : le Village by CA vend avant tout un carnet d'adresses corporate.
Comment choisir son incubateur à Lyon
Vous cherchez un incubateur. Commencez par vous demander pourquoi. La réponse détermine la structure.
Critères de choix (stade, secteur, durée, coût, prise de participation)
Cinq questions à vous poser avant de candidater :
- Quel est votre stade ? Idée (Lyon Start Up, CELSE), MVP (H7, 1Kubator), croissance (Village by CA, emlyon venture labs), deeptech (Pulsalys, Tech360).
- Quel est votre secteur ? Généraliste (H7, 1Kubator), deeptech (Pulsalys), santé (Pulsalys, HUB612), impact/ESS (Ronalpia, Alter'Incub), industrie (Tech360, Novacité), fintech (HUB612).
- Acceptez-vous une prise de participation ? 1Kubator (oui, 25K€ contre equity), Pulsalys (maturation financée), Village by CA (non), Ronalpia (non), emlyon (selon le programme).
- Quelle durée ? Court (Lyon Start Up, quelques mois), moyen (H7, Ronalpia, 9-12 mois), long (Alter'Incub, 18 mois ; Village by CA, 24 mois).
- Quel budget ? Gratuit (Lyon Start Up, Ronalpia, Alter'Incub, Pulsalys), payant (H7, Village by CA), financement inclus (1Kubator 25K€, Pulsalys maturation).
Comparatif synthétique des programmes
Généralistes : H7 (5 300 m², 500+ membres, tech/numérique), 1Kubator (25K€ + equity, réseau national), Lyon Start Up (gratuit, 70h formation)
Deeptech/Recherche : Pulsalys (100+ startups, SATT, transfert techno), emlyon venture labs (1 300 entreprises, multi-programmes), Tech360 ECAM (industrie, Fablab)
Impact/ESS : Ronalpia (265 entrepreneurs, 7 incubateurs AURA), Alter'Incub (gratuit 18 mois), Les Premières Aura (entrepreneuriat féminin)
Corporate/Spécialisé : Village by CA (40+ antennes, 800+ partenaires), Novacité (transition écologique), HUB612 (fintech/insurtech, fonds 50K-1M€)
Préparer sa candidature
Trois règles pour maximiser vos chances :
- Montrez la traction. Un MVP fonctionnel, des premiers retours utilisateurs, un marché identifié. Les incubateurs accélèrent des projets qui existent déjà.
- Connaissez la structure. Chaque incubateur a sa culture. Allez aux événements, parlez aux alumni, comprenez ce que le programme offre et ce qu'il n'offre pas.
- Sachez ce que vous cherchez. Financement, réseau, expertise technique ou clients corporate : la réponse détermine la structure, et vous évite de candidater partout.
FAQ
Quels sont les meilleurs incubateurs à Lyon ?
Les incubateurs de référence à Lyon en 2026 sont H7 (5 300 m², hub d'innovation généraliste), Pulsalys (SATT, 100+ startups deeptech créées), emlyon venture labs (1 300 entreprises créées en près de 40 ans) et 1Kubator (réseau national, 200+ startups). Le choix dépend de votre secteur et de votre stade : deeptech vers Pulsalys, généraliste tech vers H7, early-stage vers 1Kubator ou Lyon Start Up.
Comment intégrer un incubateur à Lyon ?
Chaque structure a son propre processus de candidature, généralement en ligne. Les critères communs : innovation du projet, potentiel de marché, qualité de l'équipe fondatrice. Les structures publiques (Pulsalys, Lyon Start Up) sont gratuites. Les privées (H7, 1Kubator) demandent un forfait ou prennent une participation. Conseil : assistez d'abord aux événements de la structure visée pour comprendre sa culture avant de postuler.
Combien coûte un programme d'incubation à Lyon ?
Les coûts varient selon la structure. Plusieurs programmes sont entièrement gratuits : Lyon Start Up, Ronalpia, Alter'Incub (18 mois gratuits), Pulsalys (maturation financée). D'autres impliquent un loyer subventionné (H7), un forfait mensuel (Village by CA), ou une prise de participation (1Kubator : 25 000 € contre equity). Comparez d'abord la valeur du réseau et de l'accompagnement, puis le coût.
Quelle différence entre incubateur et accélérateur ?
Un incubateur accompagne les projets dès la phase de création : structuration de l'idée, développement du produit, premiers clients. Un accélérateur prend le relais quand le produit existe et que la startup cherche à croître rapidement : développement commercial, levée de fonds, expansion. À Lyon, certaines structures combinent les deux (Pulsalys, emlyon venture labs, 1Kubator). En pratique, la frontière est floue : concentrez-vous sur le contenu du programme plutôt que sur l'étiquette.
Pour aller plus loin
- accélérateurs et incubateurs en France
- comment choisir son accélérateur
- Incubateurs et accélérateurs à Paris
- Incubateurs et accélérateurs à Marseille
- Incubateurs et accélérateurs à Bordeaux
